حضور ۲۴ ساعته و مقیم اساتید فوق‌تخصص نوزادان در کنار کادر مجرب و آموزش‌دیده مراقبت‌های ویژه، امکان ارائه خدمات مستمر و تخصصی به نوزادان را فراهم کرده است. این بخش به ونتیلاتورهای پیشرفته با مدهای تخصصی برای نوزادان، به‌ویژه نوزادان با وزن کمتر از یک کیلوگرم، مجهز است و از تجهیزات پیشرفته‌ای همچون انکوباتور، دستگاه کول‌بادی، سیستم‌های مانیتورینگ اختصاصی و مرکزی، دو دستگاه رادیولوژی موبایل دیجیتال، تجهیزات آزمایشگاهی و دستگاه ABG مستقر در بخش بهره می‌برد. همچنین پلتفرم‌های پیشرفته انتقال نوزاد مجهز به انکوباتور، بلندر، پمپ و نئوپاف و دو دستگاه انکوباتور پرتابل مجهز به سیستم‌های CPAP و بلندر، امکان انتقال ایمن نوزادان را فراهم کرده‌اند. مگا NICU امیرالمؤمنین(ع)، با بهره‌گیری از تجهیزات پیشرفته و حضور کادر تخصصی و باتجربه، آماده خدمت‌رسانی به نوزادان و خانواده‌های هم‌استانی است.